Im September 2006 hat Prof. Dr. Tanja A. Börzel einen Jean Monnet Lehrstuhl von der Europäischen Kommission zuerkannt bekommen und war von 2009 - 2012 zusätzlich Direktorin des Jean Monnet Exzellenzzentrums "The EU and its Citizens" an der Freien Universität Berlin. Durch die Förderung können Lehr- und Forschungsaktivitäten an der Arbeitsstelle ausgebaut und um Veranstaltungen sowie eine eigene Arbeitspapier-Reihe ergänzt werden. Das Jean Monnet Centre of Excellence "The EU and its Citizens" bündelte die Expertise, die Lehre und die Forschungsaktivtäten zur Europäischen Integration an der Freien Universität Berlin. Auf diese Weise stellte es die Beziehung zwischen der EU und ihren Bürgern in den Mittelpunkt und verfolgte damit eines der großen Herausforderungen der Europäischen Integration.